药物收入是医院收入的主要来源。药品开支约占卫生总费用的40%，政府拨款和补贴在公立医院收入占比10%左右的较低水平。2012年医院门诊病人次均医疗费中，药品费比例50.3%，从图4-5可见，中国药品在卫生总费用中一直占有较大比重。
图4-5 中国药品占卫生总费用的比重
世界主要国家都对药品采取不同的措施，让普通民众不会因为药品价格贵而看不起病。具体调控价格的方式参见表4-10。在欧盟，除德国和英国在新专利药品上市时可以自由定价外，几乎所有的欧盟国家都对专利药品实施直接的价格控制。[19]在大多数国家和地区，药品收入不是公立医院的主要收入来源，2010年世界上大部分国家和地区药品在卫生总费用所占的比重都不高于25%；国际上药品是医疗服务的消耗品，并不是其利润的主要来源。中国将“药品出售”与“医疗服务”的补偿来源分开，而“医疗服务”普遍低成本甚至亏损，再加上政府补贴不到位，致使医院通过出售药品创收。
表4-10 世界各国都对药品采取不同形式的价格管制
破除以药养医是医改的重点、难点。公立医院改革要继续推行基本药物零差率销售和财政补偿机制，巩固完善基本药物制度和基层医疗卫生机构运行新机制；县级公立医院改革试点继续推进，改革试点扩大到1000个县，覆盖农村5亿人口。医药分家，让医药商业回归正常盈利水平。