看罢他的回奏，崇祯大为脑火，他本以为陈新甲是会为自己担当责任，没想到陈新甲却根本不愿意，于是，他在一气之下命令将陈新甲逮捕下狱，交刑部议处。
陈新甲被关到狱中，这才意识到自己因没能为崇祯担当责任的后果，于是他便上疏请求宽免，仍在盛怒之下的崇祯自是不许。陈新甲似乎也已经明白，自己要来背这个黑锅定是无疑的了，可他仍不甘心。因此，他便向监狱内外的不少官员朋友大送银子请求他们设法解救自己。
可他没有想到的是，这一案子在刑部却是由他的老对头刑部侍郎徐石麒办理的，这位徐石麒不仅是一个坚定的东林党人，为人又是十分的小气，当初在朝堂上陈新甲因为这位刑部侍郎在奏对时一句话说得不甚妥当便站出来向崇祯评说了一番，从此他便对陈新甲怀恨在心，而且二人也慢慢地结下了怨仇。今日，陈新甲一落到了他的手上，报复心极强的徐石麒自是要对他治以重罪而后快了。
